ゲノム情報発現のしくみから生命の進化に迫る

教員

Research Summary

本研究室では、ゲノムDNA配列情報を分子系統学的観点から解析するとともに、ゲノムワイドな分子情報プロファイリングがもたらす細胞レベルの現象の知見を統合し、複雑な生命の成り立ちを理解するための研究を進めています。脊椎動物を中心とした、生物学的に際立つ特徴を持つ希少生物を含む多様な生物を対象としています。主要なテーマは以下の3つに分けられます。

1) DNA配列の種間比較によるゲノム構成の進化的変遷の解明
2) 細胞レベルの現象の理解に基づくゲノム進化機構の解明
3) ゲノムワイドな情報の取得および利用のための方法の高度化

研究活動の紹介動画

Selected Publications

Yamaguchi K, Uno Y, Kadota M, Nishimura O, Nozu R, Murakumo K, Matsumoto R, Sato K, Kuraku S. Elasmobranch genome sequencing reveals evolutionary trends of vertebrate karyotype organization. Genome Res. 2023 Sep; 33:1527-1540.
https://genome.cshlp.org/content/33/9/15273

Hara Y, Kuraku S. The impact of local genomic properties on the evolutionary fate of genes. Elife. 2023 May 24;12:e82290.
https://elifesciences.org/articles/82290

Yamaguchi K, Koyanagi M, Sato K, Terakita A, Kuraku S. Whale shark rhodopsin adapted to deep-sea lifestyle by a substitution associated with human disease. Proc Natl Acad Sci USA. 2023 Mar 28;120:e2220728120.
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2220728120

Ohishi Y, Arimura S, Shimoyama K, Yamada K, Yamauchi S, Horie T, Hyodo S, Kuraku S. Egg Yolk Protein Homologs Identified in Live-Bearing Sharks: Co-Opted in the Lecithotrophy-to-Matrotrophy Shift? Genome Biol Evol. 2023 Mar 3;15:evad028
https://academic.oup.com/gbe/article/15/3/evad028/7048455