遺伝研発の実験技術~カテゴリー別~

観察/分析/遺伝子改変/遺伝子組換え/細胞培養/バイオリソース開発/解析ツール/データベース/発表技術

・観察
  新生児大脳皮質の発達のリアルタイム観察
  脳に映される視覚世界をリアルタイム観察
  テロメア領域染色の簡便法 (培養細胞) (組織切片
  生物の複雑な構造を3次元で解き明かす論文)(facebook)(生物の構造を3D画像でご覧いただけます
  細胞内微細構造の「硬さ」「弾性」「流動性」を測る
  細胞内のオートファジーの可視化
  難病ALS、光操作で再現総説)※東京医科大学との共同研究
  バーチャルリアリティを利用して脳のはたらきを研究する

・分析
  ヘテロ接合度を考慮した実践的ゲノムアセンブル法
  テロメアクロマチンの成分分析法
  原核生物の免疫記憶を使ったウイルスゲノムの網羅的検出
  多くの検体の全DNAから特定のDNA断片を簡便に選択して解読する方法

・遺伝子改変

  光合成生物のタンパク質ノックダウン法
  AID2(改良型AID)法による酵母、培養細胞、マウスにおけるタンパク質高速分解(プロトコル)(総説)
  改良オーキシンデグロンAID2による線虫個体における迅速タンパク質分解除去法
  AID法によるヒト条件致死細胞の作成総説
  AID法による簡便な出芽酵母条件致死株作成法
  野生マウス系統のゲノム編集
  ゲノム編集の高効率化
  生体の組織の中で少数の細胞を高輝度標識し、任意の遺伝子を改変する新技術
  iVEC法による高効率クローニング技術
  マウスの交配を介さない遺伝学による条件付き遺伝子ノックアウト
  新規タグ付加ツールキットとAID法のための分解阻害剤
  ゼブラフィッシュにおける簡便な複数sgRNA発現方法
  神経細胞の誕生日タグづけ法
  ウニのゲノム編集技術※筑波大学ほかと共同開発

・遺伝子組換え
  トランスポゾンを用いた効率的な蛋白質生産※協和キリン株式会社の共同研究

・細胞培養

  ゼブラフィッシュとメダカの精子の室温保存法
  細胞培養系による精原幹細胞分化系
  植物における木部細胞の分化を試験管内で再現する

・バイオリソース開発
  遺伝的に均質なゼブラフィッシュ近交系の樹立

・解析ツール
  メタゲノム配列の遺伝情報から環境温度を予測する技術メタゲノム温度計)
  高速かつ高精度に細菌群集の系統組成を推定するツールVITCOMIC2
  「環境」から微生物を検索し、微生物から「環境」を予測するウェブツールLEA
  膨大なメタゲノムデータの相同性検索システムPZLAST)※理化学研究所との共同開発
  酵母の変異点の迅速同定法Mudi
  社会行動を自動解析するフリーウエアDuoMouse
  蛍光顕微鏡画像を非裁量的に定量解析する方法
  分析から視覚化まで〜ワンストップNGSデータ解析プラットフォームMaser
  微生物ゲノムの遺伝子アノテーションおよびDDBJ登録支援ツールDFAST
  CRISPR/Cas9のためのガイドRNA設計ソフトウエアCRISPRdirect)※
  細胞画像のわずかな特徴の違いの見分け方を教えてくれるAI ※東京大学ほかと共同開発

・データベース
  未知化合物を解析するためのメタボロームデータベース食レポ )(植レポ )(ものレポ
  実験研究者にやさしい「NIGマウスゲノムデータベース」NIG_MoG
  マウス「ミシマバッテリー」10系統の全ゲノム配列をNIG_MoG2より公開NIG_MoG2
  遺伝子発現解析の基準となるデータを快適に検索できるウェブツールRefEx)※
  “誕生日タグづけ”マウスの脳画像データベース「NeuroGT」NeuroGT

・発表技術
  「遺伝研メソッド」科学英語プレゼンテーションの出前研修

  
※ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS)発

遺伝研共同研究の公募


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