名誉教授
| 氏名（敬称略） | 前官職 | 授与年月日 |
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| 大久保 公策 | 情報研究系教授 | 2025/04/01 |
| 川上 浩一 | 遺伝形質研究系教授 | 2025/04/01 |
| 井ノ上 逸朗 | ゲノム・進化研究系教授 | 2023/04/01 |
| 齊藤 成也 | ゲノム・進化研究系教授 | 2022/04/01 |
| 相賀 裕美子 | 遺伝形質研究系教授 | 2022/04/01 |
| 荒木 弘之 | 遺伝メカニズム研究系教授 | 2020/04/01 |
| 城石 俊彦 | 遺伝形質研究系教授 | 2019/04/01 |
| 上田 龍 | 系統生物研究センター教授 | 2016/07/01 |
| 倉田 のり | 系統生物研究センター教授 | 2016/04/01 |
| 廣海 健 | 個体遺伝研究系教授 | 2014/04/01 |
| 五條堀 孝 | 生命情報・DDBJ研究センター教授 | 2014/02/01 |
| 山尾 文明 | 変異遺伝研究部門教授 | 2013/04/01 |
| 小原 雄治 | 所長 | 2013/04/01 |
| 嶋本 伸雄 | 構造遺伝学研究センター教授 | 2010/04/01 |
| 桂 勲 | 構造遺伝学研究センター教授 | 2009/04/01 |
| 舘野 義男 | 生命情報・DDBJ研究センター教授 | 2008/04/01 |
| 菅原 秀明 | 生命情報・DDBJ研究センター教授 | 2008/04/01 |
| 西川 建 | 生命情報・DDBJ研究センター教授 | 2007/04/01 |
| 廣瀬 進 | 個体遺伝研究系教授 | 2007/04/01 |
| 池村 淑道 | 集団遺伝研究系教授 | 2004/03/31 |
| 堀田 凱樹 | 所長 | 2004/04/01 |
| 石濱 明 | 分子遺伝研究部門教授 | 2002/04/01 |
| 小川 智子 | 細胞遺伝研究系教授 | 2001/04/01 |
| 沖野（森島） 啓子 | 育種遺伝研究部門教授 | 1998/04/01 |
| 今村 孝 | 人類遺伝研究部門教授 | 1998/04/01 |
| 富澤 純一 | 所長 | 1997/10/01 |
| 原田（太田） 朋子 | 集団遺伝研究部門教授 | 1997/04/01 |
| 堀内 賢介 | 微生物遺伝研究部門教授 | 1997/04/01 |
| 杉山 勉 | 発生遺伝研究部門教授 | 1996/04/01 |
| 瀬野 悍二 | 変異遺伝研究部門教授 | 1996/04/01 |
| 森脇 和郎 | 細胞遺伝研究系教授 | 1994/04/01 |
| 黒田 行昭 | 個体遺伝研究系教授 | 1990/07/09 |
| 松永 英 | 所長 | 1990/02/22 |
| 三浦 謹一郎 | 分子遺伝部長 | 1988/07/05 |
| 木村 資生 | 集団遺伝研究系教授 | 1988/07/05 |
