川本研究室・系統情報研究室

遺伝資源情報の利用とデータベースに関する研究

教員

川本　祥子

准教授

 

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Research Summary

生命科学分野では、ゲノム解読やゲノム編集をはじめとする革新的な技術をベースに、日々新たな成果が生まれています。それら研究の基盤となるのがバイオリソースでありデータベースです。研究室では、ナショナルバイオリソースプロジェクトの情報センター整備プログラムの代表並びに、生物遺伝資源センターのバイオリソース情報部門として、様々な生物遺伝資源のデータベース構築を担当しています。また、データベース統合化のための研究開発をDBCLSや理研BRCと連携し行っています。

ナショナルバイオリソースプロジェクトのWebサイト。当研究室では国内で整備されている様々な生物資源の情報を集約している。各リソースの特性やゲノム情報等のデータベースを開発している。

Selected Publications

Sakkour A, Mascher M, Himmelbach A, Haberer G, Lux T, Spannagl M, Stein N, Kawamoto S, Sato K. Chromosome-scale assembly of barley cv. ‘Haruna Nijo’ as a resource for barley genetics. DNA Res. 2022 Jan 28;29(1):dsac001.

Mizuno-Iijima S, Nakashiba T, Ayabe S, Nakata H, Ike F, Hiraiwa N, Mochida K, Ogura A, Masuya H, Kawamoto S, Tamura M, Obata Y, Shiroishi T, Yoshiki A. Mouse resources at the RIKEN BioResource Research Center and the National BioResource Project core facility in Japan. Mamm Genome. 2022 Mar;33(1):181-191.

Kajiya-Kanegae H, Ohyanagi H, Ebata T, Tanizawa Y, Onogi A, Sawada Y, Hirai MY, Wang ZX, Han B, Toyoda A, Fujiyama A, Iwata H, Tsuda K, Suzuki T, Nosaka-Takahashi M, Nonomura KI, Nakamura Y, Kawamoto S, Kurata N, Sato Y. OryzaGenome2.1: Database of Diverse Genotypes in Wild Oryza Species. Rice (NY). 2021 Mar 4;14(1):24.

川本祥子，希少疾患のためのモデル生物研究者レジストリとバイオリソースデータベースの役割，細胞 53(13)，807-810, 2021-11


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