Advanced Genomics Center

Advanced Genomics Center was established October 1st., 2011, with the aim to combine the latest genomics technology, i.e., next generation sequencing, for example, and the genetic resources, that have been collected and constructed throughout the history of this institute, to create resources for new-generation genetics.

Since such resources should have links among biological (phenotypic) annotations, data from genetic as well as genomic researches, this center will work closely with other laboratories of Genetic Strains Research Center, and research communities around the country. This center is also expected to become core facility for research communities to provide latest technologies and tools of the present-day genomics.

To answer the expectations and heavy demand of genome analyses from the universities and research communities, the target projects that will be conducted in this center will be chosen through NIG’s Collaborative Research Program that is open to researchers outside of NIG.

先端ゲノミクス推進センターの活動

大規模DNAシーケンシング、１分子DNAシーケンシング、1細胞シーケンシング
ゲノム情報解析パイプラインの開発と提供
所内外との連携による共同利用・共同研究の推進
受託研究の受け入れ
新興再興感染症の対応
情報共有と情報セキュリティ体制の確立
生命研究各分野への先端ゲノミクスの応用と支援

先端ゲノミクス推進センターは、常に最先端の技術と情報をコミュニティに提供できるよう施設の整備を進めています。

共同研究・共同利用・受託研究の流れ

大学や他の研究機関、企業と連携して、多様な生物種のゲノム・メタゲノム
や遺伝子の配列解析を行っています。

先端ゲノミクス推進センターでは、以下の生物種のゲノムやヒト・環境のメタゲノム解析を共同研究・共同利用・受託研究を通して実施しています。

動物：ヒト、チンパンジー、ニホンザル、アマミトゲネズミ、ラット、マウス、スンクス、イヌ、クジラ、イルカ、ワラビー、ニワトリ、コウモリ、アフリカツメガエル、シーラカンス、ポリプテルス、シグリッド、フグ、メダカ、キンギョ、アオイガイ、ナメクジウオ、ホヤ、線虫、ショウジョウバエ、テントウムシ、アゲハ、カイコ、クワコ、プラナリア、クマムシなど
植物：イネ、シロイヌナズナ、アサガオ、ナンヨウアブラギリ、トマト、ヒメツリガネゴケ、ワサビ、トウガラシ、イヌビワ、ハナビシソウ、甘草、サンゴ共生褐虫藻、緑藻類、接合藻類、紅藻類、微細藻類など
微生物等：ヒト常在菌、病原菌、光合成菌、極限環境細菌類、共生細菌類、難培養細菌、新型コロナウイルス
メタゲノム：ヒト(腸内、皮膚、口腔)、マウス、昆虫、海洋、河川、湖沼、土壌、温泉、活性汚泥、工業廃水、農地/液肥