ゲノムデータ解析支援センター

ゲノムデータ解析支援センター

シーラカンスのゲノムブラウザー。
シーラカンスゲノム上に注釈付けされた遺伝子やSNVなどの情報の検索と閲覧が行える。BLAST/BLATを用いた相同性検索にも対応しており、アライメントの結果を他のアノテーション情報と共に視覚的に確認することができる。

次世代シーケンシング(NGS)技術の発展によってDNAシーケンサーのスループットは飛躍的に向上し、様々な研究分野で塩基配列レベルの研究解析が行われるようになってきました。

いまやモデル生物だけではなく、あらゆる生物種を対象に、新規ゲノムシーケンスやリシーケンス(変異解析)、トランスクリプトーム解析、メタゲノム解析といった多様な配列解析が行われています。
これらの配列データを効率的に解析し、目的に応じた結果を正しく得るためには、生物学の知識に加えてバイオインフォマティクスの知識と技術が不可欠です。

本センターは、最先端の解析技術を用いたデータ解析支援事業を中心に、大量のゲノムデータを迅速かつ高精度に解析する新規技術の開発や、そのための人材育成といった活動を通して、ゲノム科学の推進に貢献します。

出版物

  • Kinoshita-Terauchi N, Shiba K, Terauchi M, Noguchi H, Inaba K. Flagellar proteomic analysis of the brown alga Mutimo cylindricus revealed a novel calcium-binding protein abundantly localized in the anterior flagellum. Protist. 2024 Dec;175(6):126070.
  • Takada K, Nakagawa S, Kryukov K, Ozawa M, Watanabe T. Metagenomic analysis of the gut microbiota of hooded cranes (Grus monacha) on the Izumi plain in Japan. FEBS Open Bio. 2024 Dec;14(12):1972-1984.
  • Kaneko S, Miyoshi K, Tomuro K, Terauchi M, Tanaka R, Kondo S, Tani N, Ishiguro KI, Toyoda A, Kamikouchi A, Noguchi H, Iwasaki S, Saito K. Mettl1-dependent m7G tRNA modification is essential for maintaining spermatogenesis and fertility in Drosophila melanogaster. Nat Commun. 2024 Sep 24;15(1):8147.
  • Fukuta K, Kato DI, Maeda J, Tsuruta A, Suzuki H, Nagano Y, Tsukamoto H, Niwa K, Terauchi M, Toyoda A, Fujiyama A, Noguchi H. Genome assembly of Genji firefly (Nipponoluciola cruciata) reveals novel luciferase-like luminescent proteins without peroxisome targeting signal. DNA Res. 2024 Apr 1;31(2):dsae006.

ゲノムデータ解析支援センター

野口 英樹 センター長

小杉 俊一 特任准教授

クリュコフ,キリル 特任准教授

寺内 真 博士研究員

馬場 知哉 特任准教授