ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）

ライフサイエンス統合データベース部門（DBCLS）

ライフサイエンス分野では、世界中で数千をこえる多様なデータベース(DB)が公開されており、その活用が研究の進展に不可欠になっています。しかし、「必要なDBが見つからない」「使い方がわからない」「データを組み合わせた高度な解析ができない」など、DBの効率的な利用のための環境整備は充分ではありません。

本部門はDB統合化の中核組織として2007年に機構直轄のセンターとして設置され、以来、DBの統合化と保全に努め、利用者の利便性を高める情報技術の研究開発やサービスの開発、DBの国際標準化を行ってきました。

2023年にはデータサイエンス共同利用基盤施設にバイオデータ研究拠点が設置され、バイオデータ研究拠点（BSI）等とはこれまで以上に強力な協力体制が構築されました。ビッグデータの有効活用の点からシナジー効果を発揮していきます。

出版物

• Ikeda S, Aoki-Kinoshita KF, Chiba H, Goto S, Hosoda M, Kawashima S, Kim JD, Moriya Y, Ohta T, Ono H, Takatsuki T, Yamamoto Y, Katayama T. Expanding the concept of ID conversion in TogoID by introducing multi-semantic and label features. J Biomed Semantics. 2025 Jan 8;16(1):1.
• Hachiya T, Ishii M, Kawai Y, Khor SS, Kawashima M, Toyo-Oka L, Mitsuhashi N, Fukuda A, Kodama Y, Fujisawa T, Tokunaga K, Takagi T. The NBDC-DDBJ imputation server facilitates the use of controlled access reference panel datasets in Japan. Hum Genome Var. 2022 Dec 20;9(1):48.
• Mitsuhashi N, Toyo-Oka L, Katayama T, Kawashima M, Kawashima S, Miyazaki K, Takagi T. TogoVar: A comprehensive Japanese genetic variation database. Hum Genome Var. 2022 Dec 12;9(1):44.
• Ikeda S, Ono H, Ohta T, Chiba H, Naito Y, Moriya Y, Kawashima S, Yamamoto Y, Okamoto S, Goto S, Katayama T. TogoID: an exploratory ID converter to bridge biological datasets. Bioinformatics. 2022 Sep 2;38(17):4194-4199.

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