ゲノム多様性研究室
森研究室
ゲノムの多様性と環境との相互作用の解明
教員
Research Summary
生物は多様なゲノムを持ち、様々な環境に適応しております。我々の研究室では、コンピュータを用いた比較ゲノム解析やメタゲノム解析等の手法によって、数万年前に絶滅した動物の古いDNAからゲノム配列情報を取得し進化系統樹を推定する研究や、メタゲノム配列から新規性の高い微生物の高精度なゲノム配列を構築してデータベース化する研究、宿主ー微生物間の共生関係をメタゲノム解析で明らかにする研究等に取り組んでおります。また、それらの解析を高度化するための情報解析技術・ツールの開発を行い、先端ゲノミクス推進部門と強く連携して、開発した情報解析技術を活かした国内外の研究機関との多数の共同研究を進めております。
系統や環境、推定された表現型等で微生物ゲノムを検索することができる。
出版物
- Mori H, Kato T, Ozawa H, Sakamoto M, Murakami T, Taylor TD, Toyoda A, Ohkuma M, Kurokawa K, Ohno H. Assessment of metagenomic workflows using a newly constructed human gut microbiome mock community. DNA Res. 2023;30(3):dsad010.
- Segawa T, Yonezawa T, Mori H, Akiyoshi A, Larramendi A, Kohno N. Ancient DNA from Palaeoloxodon naumanni in Japan reveals early evolution of Eurasian Palaeoloxodon. iScience. 2025;28(12):114156.
- Kim J, Murakami T, Toyoda A, Mori H. Behavioural phase transitions in the migratory locust, Locusta migratoria, are related to changes in the gut bacterial composition. ISME Commun. 2026;6(1):ycag009.
- Kawashima S, Okabeppu Y, Miyazawa S, Ichikawa N, Nagazumi H, Nishihara Y, Nakazato T, Goto S, Kurokawa K, Ishii M, Mori H. A curated resource of chemolithoautotrophic genomes and marker genes for CO₂ fixation pathway prediction. Sci Data. 2026;13(1):121.
- Mori H, Fujisawa T, Higashi K, Tanizawa Y, Nakagawa Z, Nishide H, Fujiyoshi M, Nakamura Y, Uchiyama I, Matsui M, Yamada T. Microbiome Datahub: an open-access platform integrating environmental metadata, taxonomy, and functional annotation for comprehensive metagenome-assembled genome datasets. Microbiome. 2026;14(1):119.