大腸菌・サルモネラ菌遺伝子や酵母遺伝子にみられるコドン選択の偏り（図4）

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大腸菌 サルモネラ菌 酵母
アミノ酸 コドン tuf
A-B		 omp
C		 trp
A-E		 thr
A,B		 13453
遺伝子		 844
遺伝子		 G3PDH enolase TRP5 CYC
1,7		 11796
遺伝子
Leu TTA 0 1 24 14 13.6 13.8 0 5 15 3 26.3
  TTG 0 0 27 23 13.2 12.1 41* 73* 24* 8* 27.2*
  CTT 2 1 17 10 11.2 11.6 0 0 4 1 12.2
  CTC 1 1 22 18 10.9 10.4 0 0 4 0 5.4
  CTA 0 0 10 3 3.9 4.6 1 0 11 1 13.4
  CTG 53* 24* 107* 55* 51.5* 50.9* 0 0 4 0 10.4
Arg CGT 41* 12* 35* 24* 20.9* 18.8* 0 2 3 0 6.5
  CGC 5* 1* 57* 23* 21.4* 21.9* 0 0 1 0 2.6
  CGA 0 0 4 6 3.6 3.7 0 0 0 0 3.0
  CGG 0 0 3 12 5.6 6.6 0 0 0 0 1.7
  AGA 0 0 2 0 2.6 2.8 22* 26* 22* 5* 21.3*
  AGG 0 0 1 2 1.6 2.0 0 0 2 1 9.3
Pro CCT 0 0 12 6 7.1 7.5 1 1 11 4 13.6
  CCC 0 0 14 6 5.3 6.0 0 0 4 0 6.8
  CCA 2 3 17 5 8.5 6.1 22 27 15 5 18.2
  CCG 38* 1* 48* 26* 22.6* 23.3* 0 0 11 0 5.3
Gln CAA 0 1 29 14 14.6 12.6 11 18 21 2 27.5
  CAG 16* 20* 58* 32* 29.0* 31.4* 0 0 6 3 12.2
Lys AAA 35* 17* 55* 24* 34.4* 34.4* 3 10 18 14 42.1
  AAG 11 0 12 21 11.3 12.5 49* 62* 26* 19* 30.8*
Ala GCT 24* 18* 34* 18* 16.1* 14.3* 49* 96* 37* 6* 21.1*
  GCC 2 0 74 44 25.1 27.6 16* 17* 14* 6* 12.6*
  GCA 11* 8* 36* 20* 20.5* 13.7* 0 0 12 2 16.2
  GCG 17* 3* 68* 43* 32.6* 39.1* 0 0 1 1 6.1
Val GTT 46* 12* 30* 27* 19.0* 16.2* 45* 32* 24* 2* 22.0*
  GTC 1 2 22 22 14.9 17.4 27* 37* 24* 1* 11.6*
  GTA 21* 9* 16* 8* 11.2* 11.9* 0 0 6 1 11.8
  GTG 6* 2* 50* 32* 25.7* 24.6* 0 0 7 2 10.7
Gly GGT 38* 29* 53* 31* 25.3* 18.4* 49* 72* 52* 16* 23.9*
  GGC 41* 19* 58* 36* 28.9* 34.6* 0* 0* 7* 3* 9.7*
  GGA 0 0 73 12 8.4 8.4 0 0 3 2 10.9
  GGG 2 0 16 14 11.1 11.6 0 0 4 3 6.0
Ser TCT 14 6 15 11 9.2 8.4 24* 28* 21* 4* 23.6*
  TCC 6 8 18 17 8.9 10.7 26* 33* 8* 1* 14.2*
  TCA 0 0 10 7 7.7 7.1 0 0 6 2 18.7
  TCG 0 0 19 11 8.7 9.4 0 0 1 1 8.6
  AGT 0 1 12 7 9.0 7.7 0 0 6 2 14.2
  AGC 1 2 26 16 15.6 17.5 0 0 1 0 9.7
Thr ACT 25* 12* 11* 5* 9.5* 7.8* 22* 17* 25* 4* 20.2*
  ACC 31* 12* 41* 21* 22.9* 24.2* 25* 23* 10* 4* 12.6*
  ACA 3 0 9 5 7.7 6.8 0 0 9 5 17.7
  ACG 1 0 21 8 14.0 18.0 0 0 2 4 8.0
Ile ATT 6 0 58 34 29.7 28.9 16* 24* 19* 5* 30.2*
  ATC 52* 10* 39* 26* 24.9* 24.1* 23* 19* 12* 3* 17.1*
  ATA 0 0 2 2 5.1 6.1 0 0 3 1 17.8
Asn AAT 0 0 29 28 18.3 18.6 0 2 11 3 36.0
  AAC 14* 32* 40* 24* 21.8* 21.5＊ 26* 38* 15* 11* 24.9*
Phe TTT 2 2 34 16 21.8 21.7 0 3 17 5 26.0
  TTC 26* 17* 32* 23* 16.6* 15.4* 21* 28* 15* 3* 18.2*
Tyr TAT 3 5 33 17 16.4 16.4 0 1 9 5 18.7
  TAC 17* 24* 21* 11* 12.3* 11.9* 20* 18* 10* 5* 14.7*
Glu GAA 60* 11* 82* 52* 39.8* 36.7* 29* 53* 33* 8* 45.9*
  GAG 13 0 32 20 18.5 21.5 0 0 9 5 19.1
Cys TGT 2 0 12 7 5.1 4.5 4 2 6 4 8.0
  TGC 4 0 18 16 6.4 6.3 0 0 1 1 4.7
His CAT 3 0 27 11 12.6 11.9 0 0 11 5 13.7
  CAC 19 1 23 9 9.7 9.4 16 20 8 2 7.8
Asp GAT 8 9 64 36 32.2 32.3 15 14 26 5 37.8
  GAC 41 23 37 18 19.5 21.2 30 47 14 4 20.4
Met ATG 18 4 44 31 27.3 26.6 13 14 10 5 20.9
Trp TGG 2 4 5 7 14.4 12.9 6 10 5 2 10.3

大腸菌と酵母でコドン選択パターンの異なるアミノ酸種を上位に、似ているものを下位に示してある。コドンはDNA型で示した。

原図、資料：池村淑道

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