National Institute of Genetics 国立遺伝学研究所 木村暁研究室

細胞がどのように建築”されているのかを、分子遺伝学・細胞生物学・コンピュータ・シミュレーションを駆使して研究します。細胞は自然が創った見事な建築物です。細胞がどのように建築されているのかを理解すれば、細胞の増殖や運動などの機能発揮のメカニズムの理解につながると考えています。 本研究室では細胞建築を理解するために、「細胞分裂サイクルを通じて細胞内構造体のダイナミックな移動やその配置がどのような力によって制御されているか?」、「その力の発生の分子的基盤は何か?」を解析しています。 この課題に取り組むにあたって、コンピュータ・シミュレーションや画像処理といったコンピュータを用いた手法を積極的に活用するのが本研究室の特色のひとつです。細胞建築は空間的な広がりを持つ上に、時々刻々と変化します。このため、シミュレーションによって仮説の挙動を把握した上で、画像処理を利用して形や動きを定量化することが有効と考えています。

The cell is a highly organized architecture that, inside the cell, organelles and the cell division plane are positioned in the right place at the right time. Our group is searching for design principles in spatial organization of cell architecture, and analyzing mechanical bases underlying the principles. We are using the nematode Caenorhabditis elegans embryo as a model system. In addition to molecular biology approaches, we use computational approaches such as image processing, quantitative measurement, and computer simulation.




_Hara Y., Iwabuchi M, Ohsumi K, *Kimura A. Intranuclear DNA density affects chromosome condensation in metazoans. Mol Biol. Cell 24, 2442–2453 (2013).

 Hara Y., *Kimura A. An allometric relationship between mitotic spindle width, spindle length, and ploidy in Caenorhabditis elegans embryos. Mol Biol. Cell 24, 1411-1419 (2013).

 Kimura K., and *Kimura A. Rab6 is required for the exocytosis of cortical granules and the recruitment of separase to the granules during the oocyte-to-embryo transition in Caenorhabditis elegans. J. Cell Sci. 125, 5897-5905 (2012).

 Okubo Y., Sugawara T., Abe-Koduka N., Kanno J., *Kimura A., *Saga Y. Lfng regulates the synchronized oscillation of the mouse segmentation clock via trans-repression of Notch signaling. Nat. Comm. 3, 1141 (2012).

 Hayashi H., Kimura K., and *Kimura A. Localized accumulation of tubulin during semi-open mitosis in the Caenorhabditis elegans embryo. Molecular Biology Cell 23, 1688-1699 (2012).

 Koyama H., Umeda T., Nakamura K, Higuchi T. and *Kimura A. A high-resolution shape fitting and simulation demonstrated equatorial cell surface softening during cytokinesis and its promotive role in cytokinesis. PLoS ONE 7, e31607 (2012).

 Niwayama R., Shinohara K., and *Kimura A. The hydrodynamic property of the cytoplasm is sufficient to mediate cytoplasmic streaming in the Caenorhabiditis elegans embryo. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 108, 11900-11905 (2011).

 Kimura K., and *Kimura A. Intracellular organelles mediate cytoplasmic pulling force for centrosome centration in the Caenorhabditis elegans early embryo. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 108, 137-142 (2011).

 Hara Y., *Kimura A. Cell-size-dependent spindle elongation in the Caenorhabditis elegans early embryo. Curr Biol. 19, 1549-1554 (2009).



Upcoming events これからの予定

November, 2014
11月1日(土)に秋葉原で行われる 遺伝研公開講演会で木村暁が講演を行います。
On November 1st (Sat), Akatsuki Kimura will give a talk at NIG public symposium at Akihabara Convention Hall.

2014年

2014/07
線虫発生/細胞生物/遺伝子発現・第6回アジア太平洋線虫合同研究会に木村健二と木村暁が参加し、木村健二が口頭発表を行いました。
Kenji Kimura and Akatsuki Kimura attended the C.elegans Development, cell biology and gene expression meeting in association with the 6th Asia-Pacific C. elegans Meeting. Kenji Kimura presented his research.
2014/06
Alexandre MAMANE君 (パリ第6大学大学院生)がJSPS summer Program fellowとして研究室に2か月滞在しました。
Alexandre MAMANE, a graduate student in Paris VI university, joined the lab as a JSPS summer program fellow for 2 months.
2014/06
Kenji Kimura, Ritsuko Arai, and Tomo Kondo attended the 66th annual meeting of the Japanese Society for Cell Biology, and presented their researches.
第66回日本細胞生物学会大会に木村健二、荒井律子、近藤興が参加し、発表を行いました。
2014/05
SASTRA University, INDIAから  Amogh JALIHAL君がNIG intern生として研究室に10週間滞在しました。
Amogh JALIHAL, a student in Sastra University, joined the lab as an NIG intern for 10 weeks.
2014/05
メンバー
菊池窯平さんがメンバーに加わりました。
Dr. Yohei Kikuchi joined the lab.
2014/04
メンバー
山本一徳さんが総研大大学院生としてメンバーに加わりました。
Kazunori Yamamoto joined the lab, as a SOKENDAI graduate student.


木村 暁

Akatsuki (Aki) KIMURA

木村 健二

Kenji KIMURA

荒井 律子

Ritsuko ARAI

近藤 興

Tomo KONDO

菊池 窯平

Yohei KIKUCHI

山本 一徳

Kazunori YAMAMOTO

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