本研究室では、野生イネと栽培イネのゲノム多様性研究および比較ゲノム解析を進めています。次世代シークエンサーを用いた多数系統ゲノムの解析、および発現遺伝子大量解析と表現型との遺伝的相関解析をテーマとしています。ここから種の多様性や進化を紐解くと同時に、種や形質の分化に関わる遺伝子を同定するものです。この中で、栽培イネの亜種間交雑や野生イネとの種間交雑にみられる生殖的隔離障壁の分子的メカニズムの解明も進めています。生殖細胞形成から初期胚発生過程における遺伝的プログラムの解明とゲノム分化、多様性解析をクロスオーバーさせ、複数のアプローチで取り組んでいます。イネ遺伝資源事業として、突然変異系統の選抜、野生イネ系統の特性解析などの研究、開発、分譲も行っています。

　　現在進めている研究課題：
　　• 野生イネ遺伝的多様性、比較ゲノム学および進化解析
　　• ゲノム障壁としての生殖的隔離機構にかかわる遺伝要因の同定、単離、機能解析
　　• イネ生殖細胞初期分化、卵および花粉形成、受粉、受精過程の遺伝的プログラムの解明
　　• イネ胚~シュート分化における遺伝的プログラムの解明

生殖的隔離遺伝子DPL1 とDPL2の同定と隔離メカニズム解析。花粉管形成に必須の遺伝子DPL1/2は、起源種で遺伝子重複し、亜種分化後片側コピーずつが機能欠損することで、生殖隔離遺伝子となった。