| 生物遺伝資源情報研究室・小原研究室 線虫発生のゲノム生物学 |
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教 授 小原 雄治 ykohara  助 教 安達 佳樹 yandachi |
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| 研究室URL : http://www.nig.ac.jp/labs/GenBiol/ | ||||
「ゲノム情報から個体がどうやってできるのか？」そのメカニズム解明のために線虫C.elegansを用いて研究を進めています。基盤的な情報を網羅的に得る作業と個別的な研究がバランスよく有機的に進むよう心がけています。基盤情報としてはcDNAプロジェクトを出発点として全遺伝子の半分以上の約14,000遺伝子の発現パターンを明らかにしてきました。さらにRNAi、抗体作成などによって機能解析を進め、「どの遺伝子が、いつ、どの細胞で、何をしているか」というゲノムの発現・機能マップデータベースNEXTDB http://nematode.lab.nig.ac.jp/ に統合化しています。これらの情報を最大限活用した個別研究では、以下のテーマで進めています。 |
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| Mangone, M. Manoharan, A., Thierry-Mieg, D., Thierry-Mieg, J., Han, T., Mackowiak, S., Mis, E., Zegar, C., Gutwein, M.R., Khivansara, V., Attie, O., Chen, K., Salehi-Ashtiani, K., Vidal, M., Harkins, T.T., Bouffard, P., Suzuki, Y., Sugano, S., Kohara, Y., Rajewsky, N., Piano, F., Gunsalus, K.C., and Kim, J.K. (2010). The Landscape of C. elegans 3'UTRs. Science 329, 432-435. Wang, X., Zhao, Y., Wong, K., Ehler, P., Kohara, Y., Jones, S.J., Mara, M.A., Holt, R.A., Moerman, D.G., and Hansen, H. (2009). Identification of genes expressed in the hermaphrodite germ line of C. elegans using SAGE. BMC Genomics 10,213. Andachi, Y.(2008). A novel biochemical method to identify target genes of individual microRNAs: Identification of a new Caenorhabditis elegans let-7 target. RNA, 14, 2440-2451. Kagoshima, H., Nimmo, R., Saad, N., Tanaka, J., Miwa, Y., Mitani, S., Kohara, Y., and Woollard, A.(2007). The C. elegans CBFb homologue BRO-1 interacts with the Runx factor, RNT-1, to promote stem cell proliferation and self-renewal. Development 134, 3905-3915. Kasahara, M., Naruse, K., Sasaki, S., Nakatani, Y., (and 31 people), Takeda,H., Morishita, S., and Kohara, Y. (2007). The medaka draft genome and insights into vertebrate genome evolution. Nature 446, 714-719. |
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