本研究室では、グローバルなゲノムの適応に着目してゲノム進化のメカニズムを解明するために、
理論と実験を組み合わせた研究を行っています。

現在の研究テーマは以下のようなものです。
タンパク質の進化と生合成過程の研究
タンパク質の構造は，細胞内での機能や生化学的特性を最適化するような自然選択によって形作られてきたと考えられます。それだけでなく、タンパク質の合成効率に働く自然選択もタンパク質の大きさ，アミノ酸組成、進化速度などを決めていると考えられます。本研究室では、遺伝子発現とタンパク質の進化パターンとの関連を研究することにより、代謝および翻訳効率に関わる適応機構を解明しています。
同義座位とタンパク質の進化の系統特異的なパターンの研究
キイロショウジョウバエとその近縁種の解析から、弱い淘汰と非平衡状態は、ショウジョウバエの分子進化の一般的特徴であることが示唆されています。
弱い力が変動しながら働く時の進化過程のモデル化
突然変異間の連鎖と適合度の相互作用を組み入れたコンピューターシミュレーションを用いて、進化上の弱い淘汰を検出するための統計的手法を開発しています。

A)　バクテリアでの生合成にかかるエネルギーの割合。バクテリアの細胞では約75%のエネルギーがタンパク質合成に使われています (Neidhardt et al. 1990)。
B)　エネルギーコストに関わるタンパク質の進化。枯草菌のゲノムを見てみると、量の多いタンパク質はコストの安いアミノ酸を使って合成されていることが分かります。