系統情報研究室・川本研究室

遺伝資源情報の利用とデータベースに関する研究

教員



Research Summary

生命科学分野では、ゲノム解読やゲノム編集をはじめとする革新的な技術をベースに、日々新たな成果が生まれています。それらの基盤となるのがバイオリソースでありデータベースです。 本研究室では、日本で進められているバイオリソースやデータベースの整備プロジェクトに貢献するとともに、遺伝医療を中心にリソースやデータベースを社会に役立てるための研究を行います。

ナショナルバイオリソースプロジェクトの情報公開サイト。国内で提供されている様々な生物資源の情報を集約している。各リソースへのリンクの他、統合検索の機能を備える。

Publications

Katayama, T., Wilkinson, M.D., Aoki-Kinoshita, K.F., Kawashima, S., Yamamoto, Y., Yamaguchi, A., Okamoto, S., Kawano, S., Kim, J.D., Wang, Y., Wu, H., Kano, Y., Ono, H., Bono. H., Kocbek, S., Aerts, J., Akune, Y., Antezana, E., Arakawa, K., Aranda, B., Baran, J., Bolleman, J., Bonnal, R.J., Buttigieg, P.L., Campbell, M.P., Chen, Y.A., Chiba, H., Cock, P.J., Cohen, K.B., Constantin, A., Duck, G., Dumontier, M., Fujisawa, T., Fujiwara, T., Goto, N., Hoehndorf, R., Igarashi, Y., Itaya, H., Ito, M., Iwasaki, W., Kalaš, M., Katoda, T., Kim, T., Kokubu, A., Komiyama, Y., Kotera, M., Laibe, C., Lapp, H., Lütteke, T., Marshall, M.S., Mori, T., Mori, H., Morita, M., Murakami, K., Nakao, M., Narimatsu, H., Nishide, H., Nishimura, Y., Nystrom-Persson, J., Ogishima, S., Okamura, Y., Okuda, S., Oshita, K., Packer, N.H., Prins, P., Ranzinger, R., Rocca-Serra, P., Sansone, S., Sawaki, H., Shin, S.H., Splendiani, A., Strozzi, F., Tadaka, S., Toukach, P., Uchiyama, I., Umezaki, M., Vos, R., Whetzel, P.L., Yamada, I., Yamasaki, C., Yamashita, R., York, W.S., Zmasek, C.M., Kawamoto, S., and Takagi, T. (2014). BioHackathon series in 2011 and 2012: penetration of ontology and linked data in life science domains. J biomed semantics 5, 5.

Kawamoto, S., and Bono, H. (2008). Portal services of life science database project in Japan. Tanpakushitsu kakusan koso 53, 281-287.