2014年度シラバス (Syllabus 2014)

e-バイオサイエンス概論:コミュニケーションと情報処理 (eBioscience Primer: biology and medicine with information technology)


===== Japanese Version =====

1. 授業科目と単位:次世代志向境界領域 I〜V e-バイオサイエンス概論
(x)講義 (x)演習 ( )実習  0.5単位

2. 履修対象者:(x)D1,(x) D2, (x)D3, (x)D4, (x)D5:
(x)生命科学研究科, (x)総研大の全研究科, その他(  ) 

3.授業担当教員:
担当教員との連絡(e-mail、電話、FAX、研究室):
(課題責任者)教 授 大久保公策(kokubo@genes.nig.ac.jp、055-981-5838、W302)
教授 有田 正規(arita@nig.ac.jp、055-981-9449、W 402)
准教授 池尾 一穂(kikeo@genes.nig.ac.jp、055-981-6851、W509)

4.授業実施期日時間:(対面講義)月曜日10:50-12:30

5.授業実施場所:(対面講義)国立遺伝学研究所図書館2Fセミナー室(B202)

6.履修条件、受講方法:特になし。

7.授業内容の概要:
eScience一般および生命系のeScience(e-BioScience)について背景と現状を解説する
(1)デジタル科学概論  
 過去20年間で 教育や論文報告を含んだ実験科学プロセスの大半がインターネットを使ったデジタルデータの処理を介して行われるようになりました。 
 研究社会に加わる者が知るべき実社会に分布した情報を駆使しての科学の仕組みについて技術的側面や制度的な側面から解説し一緒に考えます。
(2)デジタル生命科学
 実験計画や実験の解析、解釈や結果の公知共有、再利用そしては科学における重要なプロセスです。
 的確に多くの報告事実を知り、既存のデータを再利用するため またはされるために必要なリソースやその利用技術提供技術について解説します。

8.授業の達成目標:eBioScience(デジタル生命科学)に必要な背景知識の獲得。

9.授業計画:(対面講義)

  日程各回の責任者テーマ/内容
第1回  5月12日 大久保公策デジタル科学概論
第2回  5月19日 大久保公策 デジタル生命科学-1 概論
第3回  5月26日 有田 正規 デジタル生命科学-2 生命系のデータベース
第4回  6月 2日 池尾 一穂デジタル生命科学-3 生命系の巨大データとその利用

10.使用参考書、参考文献:
・"Harnessing the Power of Digital Data for Science and Society"
 Report of the Interagency Working Group on Digital Data to the Committee on Science of the National Science and Technology Council, USA January 2009
 http://www.nitrd.gov/About/Harnessing_Power_Web.pdf

・The Fourth Paradigm
 Edited by Tony Hey, Stewart Tansley, and Kristin Tolle
  https://research.microsoft.com/en-us/collaboration/fourthparadigm/

11.単位修得要件と成績評価基準:
出席とレポートで評価する。 A,B及びCを合格、Dを不合格として評価する。

12.その他のコメント:特になし


===== English Version =====

Syllabus 2014

eBioscience Primer


1. Course Title, style, and credit: Perspective of Frontiers I-V  eBioscience Primer:
(x)Lecture, (x) Discussions ( )Practice  0.5 credit

2. Appropriate grade level and Eligible Departments: (x)1, (x)2, (x)3, (x)4, (x)5:
(x)School of Life Science,
(x) All Departments,
( ) Other ( )
3. Lecturer(s):
Contacts to the lecturer (e-mail address, Tel and Fax numbers, and the office):
Professor Kousaku Okubo(kokubo@nig.ac.jp,055-981-5838, Room W302)
Professor Masanori Arita(arita@nig.ac.jp,055-981-9449, Room W402)
Associate Professor Kazuho Ikeo(kikeo@nig.ac.jp, 055-981-6851, W509)

4. Time: (oral) 10:50-12:30 on Monday

5. Place: (oral) 2F seminar room of the library in National Institute of genetics

6. Prerequisites and Styles: None

7. Contents:
Priming lectures will be given on eScience in general and in LifeScince.
(1) eScience primer
In the last 20 years, the majority of proceses in experimental science has become digital and computational.
By giving broad look at the science process, technical and institiutional issues which all of you need to know will be discussed.

(2) eBioScience primer
Planning, modeling/hypothesis generation, data processing and analysis, interpretation. presentation and report; most of these processes that used to performed mentally are assisted by information and communication technologies in eBioScience. The backgrounds and basics of these assisting mechanisms to make full use of them will be discussed.

8. Course objectives: Understanding the basics of eScinence in general and in lifesciences.
 
9. Schedule: (Oral)

  Date LecturerTopic
1. May 12 Kousaku OkuboeScience Primer
2. May 19 Kousaku Okubo eBioScience Primer-1
3. May 26 Masanori Arita eBioScience Primer-2: Database in biology
4. June 2 Kazuho Ikeo eBioScience Primer-3: Handling BigData

10. Lecture materials and readings
・"Harnessing the Power of Digital Data for Science and Society"
 Report of the Interagency Working Group on Digital Data to the Committee on Science of the National Science and Technology Council, USA January 2009
 http://www.nitrd.gov/About/Harnessing_Power_Web.pdf

・The Fourth Paradigm
 Edited by Tony Hey, Stewart Tansley, and Kristin Tolle
 https://research.microsoft.com/en-us/collaboration/fourthparadigm/

11. Grades:
Attendance and reports  Grades will be given by A,B,C, or D.

12.Notes:None




更新日=2014年 4月 9日