2007年度シラバス (Syllabus 2007)

システム生物学特論 (Systems Biology)


===== Japanese Version =====

1.授業科目と単位:次世代志向境界領域 I〜V システム生物学特論
(x)講義 ( )演習 ( )実習  0.5単位

2.履修対象者:(x)D1,(x) D2, (x)D3, (x)D4, (x)D5:
(x)生命科学研究科, (x)総研大の全研究科, その他(  )

3.授業担当教員:
担当教員との連絡(e-mail、電話、FAX、研究室):
教授 小原 雄治 (ykohara@lab.nig.ac.jp, 電話 055-981-6854, 国立遺伝学研究所C907)
教授 舘野 義男 (ytateno@genes.nig.ac.jp, 電話 055-981-6857, 国立遺伝学研究所W404)
質問はe-mail かe-mailで調整した時間の面談を歓迎。

4.授業実施期日時間:(対面講義)月曜日 10:50-12:30

5.授業実施場所:(対面講義)国立遺伝学研究所図書館3Fセミナー室

6.履修条件、受講方法:
分子細胞生物学Iまたはそれに対応する知識を持っていることが望ましいが必須ではない。

7.授業内容の概要:
ゲノム、トランスクリプトーム、プロテオーム等の網羅的方法を通して、細胞の生理や発生
・分化などの生命現象の成り立ち、調節ネットワーク、生物の多様性を論じ、ゲノム解析の
ためのデータベース構築の原理も概説する。

8.授業の達成目標:
1)システム生物学の歴史的背景、めざすところを理解する。
2)システム生物学のためのデータ取得のための特有の手法、問題点を理解する。
3)システム生物学からの知識抽出の手法、問題点を理解する。

9.授業計画:(対面講義)
  日程内容
第1回10月29日小原雄治生命現象の網羅的測定/オーミックデータの取得と解析
の方法、その性質について
第2回11月 5日小原雄治生命現象のシステム的理解1/オーミックデータを基盤
とする様々な生命現象の理解に向けた研究(細胞、発生・ 分化を中心に)
第3回11月19日舘野義男生命現象のシステム的理解2/オーミックデータを基盤
とする様々な生命現象の理解に向けた研究(遺伝子発現
ネットワーク、進化・多様性を中心に)
第4回11月26日舘野義男生物データベース構築原理/オーミックデータを格納・
統合し知識抽出するためのデータベース構築の基礎を紹 介

留学生の受講生が1名以上いれば英語で講義する。

10.使用参考書、参考文献:なし

11.単位修得要件と成績評価基準:
達成目標1〜3のうち1点以上について調査あるいは見解をレポートにて期限までに提出し
た受講者のうち、要点を理解していると判定されたものに単位を認定する。成績は可否で示
される。

12.その他のコメント:特になし


===== English Version =====

1.Course Title, style, and credit: Perspective of Frontiers I-V
Systems Biology:Towards system-level understanding of life
(x)lecture, ( ) Discussions ( )practice 0.5 credit

2.Appropriate grade level and Eligible Departments: (x)1, (x)2, (x)3, (x)4, (x)5:
(x)School of Life Science, (x) All Departments, ( ) Other ( )  )

3.Lecturer(s):
Yuji Kohara(ykohara@lab.nig.ac.jp, Tel: 055-981-6854, RoomC709)
Yoshio Tateno(ytateno@genes.nig.ac.jp, Tel: 055-981-6857, Room W404)
The first contact and submission of the paper by e-mail are most welcome.

4.Time: (oral) 10:50-12:30 on Monday

5.Place: (oral) 3F seminar room of the library in National Institute of genetics

6.Prerequisites and Styles:
It is desirable to have the basic knowledge corresponding to the lecture of Molecular and Cellular Biology I, but it is not essential.

7.Contents:
We lecture on system-level studies of various biological phenomena including cellular proliferation, development and differentiation, gene expression network, evolution and biodiversity through so-called 'omics' approaches (systematic analyses of genome, transcriptome, proteome, metabolome, etc.). Our lecture is extended to the basis of the construction of biological databases for 'omics'.

8.Course objectives:
1) To understand the historical background and its aim of systems biology
2) To understand the methods and their problems of data acquisition for systems biology
3) To understand the methods for knowledge extraction from systems biology and their problems

9.Schedule: (Oral)
  Date [lecturers if omnibus]Topic
1.Oct. 29:Yuji Kohara,How to measure biological phenomena / To be lectured on the
strategies of 'omics' approaches and their nature.
2.Nov. 5:Yuji Kohara,System-level analysis of biological phenomena #1 / To be lectured on the studies of system-level analysis of various biological phenomena,focusing on cellular proliferation, development and differentiation.
3.Nov. 19:Yoshio Tateno,System-level analysis of biological phenomena #2 / / To be lectured on the studies of system-level analysis of various biological phenomena,focusing on gene expression network, evolution and biodiversity.
4.Nov. 26:Yoshio Tateno,Construction of biological databases / To be lectured on the basis of the construction of biological databases aiming at the integration of omics data and knowledge extraction.

10.Lecture materials and readings

11.Grades:
The grades will be either “passed” or “failed”, which is determined by the quality of the paper, which must be submitted to the lecturer by the provided deadline. The subject(s) of the paper must be one of the three important aspects that are presented in the above Course Objectives.

12.Notes:None


更新日=2007年11月5日