2009年度シラバス (Syllabus 2009)

ゲノム生物学(微生物・植物) Genome Biology (Microorganism, Plant)


===== Japanese Version =====

1. 授業科目と単位:次世代志向境界領域 I〜V ゲノム生物学(微生物・植物)
(x)講義 ( )演習 ( )実習  0.5単位

2. 履修対象者:(x)D1,(x) D2, (x)D3, (x)D4, (x)D5:
(x)生命科学研究科, ( )総研大の全研究科, その他(  ) 

3.授業担当教員: 教授 仁木 宏典(微生物) 教授 倉田 のり(植物) 准教授 野々村 賢一(植物)
担当教員との連絡(e-mail、電話、FAX、研究室):
 微生物:教 授 仁木宏典(hniki@lab.nig.ac.jp、電話055-981-6870、FAX055-981-6826、R302)
 植 物:教 授 倉田のり(nkurata@genes.nig.ac.jp、電話055-981-6808、FAX055-981-6879、R111)
 植 物:准教授 野々村賢一(knonomur@lab.nig.ac.jp、055-981-6872、FAX055-981-5872、V101)

4.授業実施期日時間:(対面講義)月曜日10:50-12:30

5.授業実施場所:(対面講義)国立遺伝学研究所図書館3Fセミナー室

6.履修条件、受講方法:履修に関する付帯条件はない。

7.授業内容の概要:
 ゲノム生物学は、生物の遺伝要素の集合体の構造的特徴を取り出し、個体毎、集団毎、種毎の構造的特徴の持つ意味や、それらの構造と生物学的機能との間にどのような関連があるかを、遺伝要素全体の集合の中から実験と情報学により読み解く研究領域である。またこれらの基盤をベースに多彩な機能ゲノム学の手法や遺伝資源の開発が進み、大量データと相まってオーム学への展開や、遺伝学の新たな展開が進んでいる。ダイナミックに動いている研究領域の流れを、微生物と植物の分野について解説する。

8.授業の達成目標:

  1. ゲノム生物学は急速な発展をとげている分野であるので、この分野が発展するに至った基盤を理解すること。
  2. ゲノム生物学は生物の遺伝要因を全体として捕らえる手法であり、全体と個別の関係性の解析が重要であることの理解。
  3. ゲノム生物学は生物種を超えて普遍的な手法が使われる場合も多いが、微生物、植物に特徴的な観点もあることの理解。
  4. ゲノム生物学は多様な方法論が相呼応して発展しており、今後生物学のいくつかの概念転換をもたらすべき分野であることを洞察すること。

9.授業計画:(対面講義)

  日程内容 
第1回4月20日微生物ゲノム生物学の基礎(仁木)
第2回4月27日微生物ゲノム生物学の応用と展開(仁木/柳原)
第3回5月18日植物ゲノム生物学の基盤と応用への展開(野々村)
第4回5月25日植物ゲノム生物学の特徴と進化遺伝生物学への展開(倉田)

英語で講義する。留学生の受講生がいない場合は、日本語を用いる事もある。

10.使用参考書、参考文献:
講義で使用する資料は、受講者にファイルあるいはプリントアウトとして配布する。

11.単位修得要件と成績評価基準:
達成目標1-4のうち1点以上について調査あるいは見解をレポートにて期限までに提出した受講者のうち、1点以上の要点を理解していると判定されたものに単位を認定する。成績は合格/不合格で示される。対面講義であるので、出席も評価する。

12.その他のコメント:
教材はWebLSを用いる予定で、メモ以外のノートを取る必要はほとんどない。


===== English Version =====

1.Course Title, style, and credit: Perspective of Frontiers I-V Genome Biology (Microorganism, Plant)
(x)Lecture, (x) Discussions ( )Practice  0.5 credit

2.Appropriate grade level and Eligible Departments: (x)1, (x)2, (x)3, (x)4, (x)5:
(x)School of Life Science,
(x) All Departments,
( ) Other ( )

3.Lecturer(s):
Contacts to the lecturer (e-mail address, Tel and Fax numbers, and the office):
Professor Hironori Niki (Microorganism)(hniki@lab.nig.ac.jp, Tel 055-981-6870, Fax 055-981-6826、National Institute of Genetics R302 )
Professor Nori Kurata (Plant)(nkurata@genes.nig.ac.jp, Tel 055-981-6808, FAX055-981-6879, National Institute of Genetics R111 )
Associate Professor Nonomur Ken-ichi (Plant)(knonomur@lan.nig.ac.jp, Tel 055-981-6872, Fax 055-981-5872, National Institute of Genetics V101)

4.Time: (oral) 10:50-12:30 on Monday

5.Place: (oral) 3F seminar room of the library in National Institute of genetics

6.Prerequisites and Styles:
There is no prerequisite for taking the lectures.

7.Contents:
The genome biology is one of the rapidly growing study fields that aims to discover the meaning of structural features of genetic factors in individuals, populations and species of the organisms and relationships between structure of whole genetic factors and functional properties of the organism. The movements of genome biology studies have taken new turns in genetics and OME studies depending on the development of multiple novel methodologies/tools of functional genomics including informatics and genetic resources as well as a huge amount of molecular information. Lecturers will explain dynamic movements on genomic studies in microorganisms and plants.

8.Course objectives:

  1. The bases and reasons of a rapid development of genome biology are important to be understood.
  2. In genome biology, it is important to understand organisms as whole genetic entities and relations between parts and whole of them as well.
  3. These are some specific understandings in microorganisms and plants, though genome biology employs a lot of common methods among organisms.
  4. It should be important to have a insight that this field contains high potentiality to bring several large conceptual conversion in biological studies.

9.Schedule: (Oral)

  Date [lecturers if omnibus]Topic
1. 20 April Basics of microbial genomics (NIKI)
2.27 AprilAccomplishments of microbial genomics (NIKI/Yanagihara)
3. 18 MayPlant genome biology; Basics of plant genome biology and its turn to application (Nonomura)
4. 25 May Features of plant genomics and its turn to evolutional genetics (Kurata)

10.Lecture materials and readings:
All the materials will be supplied as electric files or print-outs before or in the lecture.

11.Grades:
The grades will be either "pass" or "fail", which is determined by the quality of the paper, which must be submitted to the lecturer by the provided deadline. The subject(s) of the paper must be one of the four important aspects that are presented in the above Course Objectives. Attendance will be considered in some extent.

12.Notes:
Since all the materials will be supplied, you may not need to make detailed notes.




更新日=2009年4月10日