===== Japanese Version =====
１． 授業科目と単位：次世代志向境界領域 I〜V 遺伝子発現ゲノム論
(x)講義 (x)演習 ( )実習 0.5単位２． 履修対象者：(x)D1,(x) D2, (x)D3, (x)D4, (x)D5:
(x)生命科学研究科, (x)総研大の全研究科, その他（ ）３．授業担当教員：
担当教員との連絡（e-mail、電話、FAX、研究室）：
（課題責任者）教 授 大久保公策（kokubo@genes.nig.ac.jp、055-981-5838、W302）
准教授 池尾 一穂（kikeo@genes.nig.ac.jp、055-981-6851、W509）４．授業実施期日時間：（対面講義）月曜日10:50-12:30
５．授業実施場所：（対面講義）国立遺伝学研究所図書館2Fセミナー室(B202) (図書館3Fセミナー室のシステム不具合の為）
６．履修条件、受講方法：特になし。
７．授業内容の概要：
・測定にはじまるデジタル科学一般の問題を代表としての 遺伝子発現データを中心とする研究につき解説する。
・遺伝子発現のゲノムワイドな解析の実際と、それを通して見えてくる生命原理を、様々な形質、 生理、病態および進化的側面から捉えて論じる。
（１）デジタル科学概論
過去２０年間で 教育を含んだ実験科学プロセスの大半がインターネットを使ったデジタルデータの機械的な処理を介して行われるようになりました。
実社会に分布した情報を駆使して研究社会に加わる者が知るべき科学の仕組みについて技術的側面や制度的な側面から解説し一緒に考えます。
（２）データとデータベース 知識と文献
実験計画や実験の解釈や考察は科学における重要なプロセスです。
そこでは多くの他の研究者の知識や経験が参考になれます。
的確に多くの報告事実を知り、的確に既存のデータを再利用するために必要なリソースやその利用技術について解説します。８．授業の達成目標：遺伝子発現データの解析に必要な背景知識の獲得。
９．授業計画：（対面講義）
日程 各回の責任者 テーマ／内容 第１回 ５月１４日 大久保公策 概論 生命科学と情報 第２回 ５月２８日 大久保公策 データ と データベース (1) 文献・知識 第３回 ６月 ４日 池尾 一穂 データ と データベース (2)ゲノム情報 第４回 ６月１１日 池尾 一穂 情報抽出手法 １０．使用参考書、参考文献：
・"Harnessing the Power of Digital Data for Science and Society"
Report of the Interagency Working Group on Digital Data to the Committee on Science of the National Science and Technology Council, USA January 2009
http://www.nitrd.gov/About/Harnessing_Power_Web.pdf・The Fourth Paradigm
Edited by Tony Hey, Stewart Tansley, and Kristin Tolle
https://research.microsoft.com/en-us/collaboration/fourthparadigm/１１．単位修得要件と成績評価基準：
出席とレポートで評価する。 A,B及びCを合格、Dを不合格として評価する。１２2．その他のコメント：特になし
===== English Version =====
Syllabus 2012
Expression Profiles in Genomics
１．Course Title, style, and credit: Perspective of Frontiers I-V Expression Profiles in Genomics
(x)Lecture, (x) Discussions ( )Practice 0.5 credit２．Appropriate grade level and Eligible Departments: (x)1, (x)2, (x)3, (x)4, (x)5:
(x)School of Life Science，
(x) All Departments，
( ) Other ( )
３．Lecturer(s):
Contacts to the lecturer (e-mail address, Tel and Fax numbers, and the office):
Professor Kousaku Okubo（kokubo@genes.nig.ac.jp,055-981-5838, Room W302）
Associate Professor Kazuho Ikeo（kikeo@genes.nig.ac.jp, 055-981-6851, W509）４．Time: (oral) 10:50-12:30 on Monday
５．Place: (oral) 2F seminar room of the library in National Institute of genetics
６．Prerequisites and Styles： None
７．Contents:
・Lectures will be given on Digital Science in general as well as on genome-wide expression profiles and their applications in genomics.
・Lectures will be given on genome-wide expression profiles and their applications in genomics.
・In the last 20 years, the majority of proceses in experimental science has become digital and computational.
By giving broad look at the science process, technical and institiutional issues which all of you need to know will be discussed.
・Planning, hypothesis/model generation and interpretation of the results are all brain works in experimental science.
In all these steps, the existing reports and records by other researchers need to be employed and processed.
Digital resources and technologies that helps your brain work will be discussed.８．Course objectives: Acquisition of background knowledge required for gene expression measurement and analysis.
９．Schedule: (Oral)
Date Lecturer Topic 1. May 14 Kousaku Okubo Over view of digital Science 2. May 28 Kousaku Okubo Data and databases 3. June 4 Kazuho Ikeo Data and databases 4. June 11 Kazuho Ikeo Data analysis １０．Lecture materials and readings
・"Harnessing the Power of Digital Data for Science and Society"
Report of the Interagency Working Group on Digital Data to the Committee on Science of the National Science and Technology Council, USA January 2009
http://www.nitrd.gov/About/Harnessing_Power_Web.pdf・The Fourth Paradigm
Edited by Tony Hey, Stewart Tansley, and Kristin Tolle
https://research.microsoft.com/en-us/collaboration/fourthparadigm/１１．Grades:
Attendance and reports Grades will be given by A,B,C, or D.12．Notes：None