===== Japanese Version =====
1. 授業科目と単位:次世代志向境界領域 I〜V 遺伝子発現ゲノム論
(x)講義 (x)演習 ( )実習 0.5単位2. 履修対象者:(x)D1,(x) D2, (x)D3, (x)D4, (x)D5:
(x)生命科学研究科, (x)総研大の全研究科, その他( )3.授業担当教員:
担当教員との連絡(e-mail、電話、FAX、研究室):
教 授 大久保公策(kokubo@genes.nig.ac.jp、055-981-5838、W302)
准教授 池尾 一穂(kikeo@genes.nig.ac.jp、055-981-6851、W509)4.授業実施期日時間:(対面講義)月曜日10:50-12:30
5.授業実施場所:(対面講義)国立遺伝学研究所図書館3Fセミナー室
6.履修条件、受講方法:特になし。
7.授業内容の概要:
・測定にはじまるデジタル科学一般の問題を代表としての 遺伝子発現データを中心とする研究につき解説する。
・遺伝子発現のゲノムワイドな解析の実際と、それを通して見えてくる生命原理を、様々な 形質、生理、病態および進化的側面から捉えて論じる。8.授業の達成目標:遺伝子発現データの解析に必要な背景知識の獲得。
9.授業計画:(対面講義)
日程 各回の責任者 テーマ/内容 第1回 6月22日 大久保公策 デジタル科学総論 第2回 6月29日 池尾 一穂 発現データとデータベース 第3回 7月 6日 大久保公策 発現の進化 第4回 7月13日 池尾 一穂 発現データ解析・解釈 10.使用参考書、参考文献:
・ゲノム機能 発現プロファイルとトランスクリプトーム 松原謙一 榊佳之 中山書店
・実例クラスター分析 西田英郎 佐藤嗣二 訳 内田老鶴圃
・Harnessing the Power of Digital Data for Science and Society , National Science and Technology Council , USA11.単位修得要件と成績評価基準:
出席とレポートで評価する。122.その他のコメント:特になし
===== English Version =====
1.Course Title, style, and credit: Perspective of Frontiers I-V Expression Profiles in Genomics
(x)Lecture, (x) Discussions ( )Practice 0.5 credit2.Appropriate grade level and Eligible Departments: (x)1, (x)2, (x)3, (x)4, (x)5:
(x)School of Life Science,
(x) All Departments,
( ) Other ( )
3.Lecturer(s):
Contacts to the lecturer (e-mail address, Tel and Fax numbers, and the office):
Professor Kousaku Okubo(kokubo@genes.nig.ac.jp,055-981-5838, Room W302)
Associate Professor Kazuho Ikeo(kikeo@genes.nig.ac.jp, 055-981-6851, W509)4.Time: (oral) 10:50-12:30 on Monday
5.Place: (oral) 3F seminar room of the library in National Institute of genetics
6.Prerequisites and Styles: None
7.Contents:
・Lectures will be given on Digital Science in general as well as on genome-wide expression profiles and their applications in genomics.
・Lectures will be given on genome-wide expression profiles and their applications in genomics.8.Course objectives: Acquisition of background knowledge required for gene expression measurement and analysis.
9.Schedule: (Oral)
Date Lecturer Topic 1. June 22 Kousaku Okubo Over view of digital Science 2. June 29 Kazuho Ikeo Data and databases 3. July 6 Kousaku Okubo Evolution of Gene Expression 4. July 13 Kazuho Ikeo Data analysis and interpretation 10.Lecture materials and readings
Cluster Analysis for Researchers H. C. Romesburg, Robert E. Krieger Publishing Company, Inc. Malabar Florida.
Harnessing the Power of Digital Data for Science and Society , National Science and Technology Council , USA11.Grades: Attendance and reports
12.Notes:None