===== Japanese Version =====
1. 授業科目と単位:次世代志向境界領域 I〜V 遺伝子発現ゲノム論
(x)講義 ( )演習 ( )実習 0.5単位2. 履修対象者:(x)D1,(x) D2, (x)D3, (x)D4, (x)D5:
(x)生命科学研究科, (x)総研大の全研究科, その他( )3.授業担当教員:
担当教員との連絡(e-mail、電話、FAX、研究室):
教 授 大久保公策(kokubo@genes.nig.ac.jp、055-981-5838、W302)
准教授 池尾 一穂(kikeo@genes.nig.ac.jp、055-981-6851、W509)4.授業実施期日時間:(対面講義)月曜日10:50-12:30
5.授業実施場所:(対面講義)国立遺伝学研究所図書館3Fセミナー室
6.履修条件、受講方法:特になし。
7.授業内容の概要:
遺伝子発現のゲノムワイドな解析の実際と、それを通して見えてくる生命原理を、様々な形
質、生理、病態および進化的側面から捉えて論じる。8.授業の達成目標:遺伝子発現データの解析に必要な背景知識の獲得。
9.授業計画:(対面講義)
日程 各回の責任者 テーマ/内容 第1回 5月 7日 大久保公策 発現測定法 第2回 5月14日 池尾 一穂 発現データとデータベース 第3回 5月28日 大久保公策 発現データ解析・解釈1 第4回 6月 4日 池尾 一穂 発現データ解析・解釈2 10.使用参考書、参考文献:
ゲノム機能 発現プロファイルとトランスクリプトーム 松原謙一 榊佳之 中山書店
実例クラスター分析 西田英郎 佐藤嗣二 訳 内田老鶴圃11.単位修得要件と成績評価基準:
出席とレポートで評価する。12.その他のコメント:特になし
===== English Version =====
1.Course Title, style, and credit: Perspective of Frontiers I-V Expression Profiles in Genomics
(x)Lecture, (x) Discussions ( )Practice 0.5 credit2.Appropriate grade level and Eligible Departments: (x)1, (x)2, (x)3, (x)4, (x)5:
( )School of Life Science,
(x) All Departments,
( ) Other ( )
3.Lecturer(s):
Contacts to the lecturer (e-mail address, Tel and Fax numbers, and the office):
Professor Kousaku Okubo(kokubo@genes.nig.ac.jp,055-981-5838, Room W302)
Associate Professor Kazuho Ikeo(kikeo@genes.nig.ac.jp, 055-981-6851, W509)4.Time: (oral) 10:50-12:30 on Monday
5.Place: (oral) 3F seminar room of the library in National Institute of genetics
6.Prerequisites and Styles: None
7.Contents:
Lectures will be given on genome-wide expression profiles and their applications in genomics.8.Course objectives: Acquisition of background knowledge required for gene expression measurement and analysis.
9.Schedule: (Oral)
Date Lecturer Topic 1. May 7 Kousaku Okubo Measurement methods 2. May14 Kazuho Ikeo Data and databases 3. May28 Kousaku Okubo Data analysis and interpretation 1 4. June 4 Kazuho Ikeo Data analysis and interpretation 2 10.Lecture materials and readings
Cluster Analysis for Researchers H. C. Romesburg, Robert E. Krieger Publishing Company, Inc. Malabar Florida.11.Grades: Attendance and reports
12.Notes:None